Κάθε φοιτητής είναι υποχρεωμένος να εκπονήσει πτυχιακή εργασία με θέμα που πρέπει να έχει άμεση σχέση με το γνωστικό αντικείμενο του Τμήματος. Τα τακτικά μέλη του Ε.Π. και Επιστημονικοί, Εργαστηριακοί Συνεργάτες που διδάσκουν στο Τμήμα, προτείνουν θέματα πτυχιακής εργασίας που ανακοινώνονται έγκαιρα στους φοιτητές. Για την εκπόνηση της πτυχιακής εργασίας χρησιμοποιούνται, εφόσον είναι απαραίτητο, οι χώροι και ο εξοπλισμός καθώς επίσης τυχόν αναγκαία οικονομικά μέσα του ΤΕΙ Κρήτης. Επίσης η πτυχιακή εργασία μπορεί να πραγματοποιηθεί επίσης εκτός ΤΕΙ, σε Οργανισμούς, Ιδρύματα, Επιχειρήσεις, Υπηρεσίες κ.λπ.. Τις αναθέσεις και τις προϋποθέσεις ανάθεσης πτυχιακών εργασιών και κάθε άλλο σχετικό θέμα καθορίζει με απόφασή του ο Τομέας και επικυρώνεται από το Συμβούλιο του Τμήματος.
Κοινό θέμα πτυχιακής εργασίας μπορεί να ανατεθεί και σε ομάδα φοιτητών όχι άνω των τριών (3), μετά από πρόταση του Τομέα και απόφαση του Συμβουλίου του Τμήματος.