Το Τ.Ε.Ι. Κρήτης περιλαμβάνει τις παρακάτω σχολές: Σχολή Διοίκησης και Οικονομίας (Σ.Δ.Ο.) Σχολή Επαγγελμάτων Υγείας και Πρόνοιας (Σ.Ε.Υ.Π) Σχολή Εφαρμοσμένων Επιστημών Γενικά Σχολή Τεχνολογίας Γεωπονίας (Σ.ΤΕ.Γ.) Σχολή Τεχνολογικών Εφαρμογών (Σ.Τ.ΕΦ)